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據統計，目前我國注冊的生物技術公司共有200多家左右，真正涉及到基因工程技術的不到100家，其中已申報基因工程藥物、并在有關部門登記立項的只有60家左右，而已取得生產基因工程藥物試產或生產批文的企業僅為48家，這些企業主要分布在一些經濟發達的省、市和經濟開發區，如北京、上海、廣東、浙江、江蘇、吉林、山東、遼寧等。由于我國生物制藥企業規模比較小，產量沒有達到規模化的程度，產品售價較高，再加上廠商的市場銷售網絡不全，因此我國的市場銷售額還比較小，目前我國一年的銷售額還不如美國或日本一家中等生物制藥公司的年產值，因此我國生物制藥企業在產業化和規模化方面還同國外有很大的差距。雖然銷售額小，但在過去的幾年我國企業一直能保持年均15%以上增幅，并且近年來銷售的增長速度有加快的趨勢。另外，近幾年來我國的市場的進口率趨于下降，目前這個比率保持在36%左右。從企業的銷售狀況來看，99年銷售額過億元的只有4家：深圳科興、天壇生物、深圳康泰、沈陽三生，其它企業的年銷售額都在幾百萬至幾千萬之間。
從各個具體產品來看，干擾素在我國市場銷售狀況，1997年干擾素的銷售額達5億元，遠高于其它的銷售額；其次，白細胞介素-2的產銷額也在億元以上。
雖然從全行業的角度來看，國外生物制藥業仍處于虧損狀態，但由于我國生物制藥業以仿制國外的（只有α-1b干擾素是我國自行研制生產的）為主，企業自身沒有投入高額的開發費，所以從整體上來說，我國生物制藥業沒有出現全行業的虧損狀況。1999年全國生物制藥業的盈利能力約達12億元，估計2000年全國生物制藥業的盈利可達16-26億元。
也正是由于國內生物制藥企業以仿制為主，所以我國沒有出現盈利能力很強、能迅速成長的生物制藥企業。近年來，對高額利潤的期望使得國內生物工程產業投資過熱，從而造成了生物而生產企業多的現象，一個產品往往有5-30個廠家在生產，而一般來說，如果規模化生產的工藝成熟，一個企業生產的產品就能滿足中國市場的需求，所以目前許多生物制藥企業每年只能開工數月，大量的設備和人員處于閑置狀態，同時由于市場競爭激烈，廠家之間競相削價，結果使得企業的投入產出比下降，許多企業陷入了困境。
國外生物制藥業的發展狀況 上，生物制藥業主要集中在美國、日本和歐洲，其中美國作為生物制藥的發源地，無論是在經費投入、產品開發和研制，還是在產品生產和市場上都居于地位。